擔心端午節連假造成新冠肺炎疫情群聚感染，中央流行疫情指揮中心一再呼籲民眾不要出門，並規定雙鐵及國道客運每個車廂只能坐滿2成。交通部路政司10日表示，截至6月9日，端午連假期間高鐵預訂車票3萬8863張，乘載率5.55％；台鐵預訂車票2萬6250張，乘載率3.56％；國道客運預訂車票4863張，乘載率3.78％，都遠低於指揮中心要求的2成。

路政司表示，另為減少高速公路車流，亦請高公局特別加強匝道儀控管制，並延長儀控紅燈秒數，控管車流量在以往連假的交通量1／2以下，整體連假交通疏運工作除維持最低限度基本民行外，將以落實防疫，減少疫情擴散為主。