雲林縣麥寮鄉濁水溪出海口生態豐富，政府單位與在地生態團體規畫生態區，目前已記錄到200多種鳥類，其中還有瀕危的東方草鴞，但面對陸域風力發電機組的設置，棲地可能遭到破壞，目前麥寮鄉內已設有20餘座風機，將再預列16座，引發生態保育與風電發展的議論。
雲林縣沿海地區進入冬季野鳥季，已有為數可觀的上百種野鳥出沒各溼地與河川出海口，位於麥寮鄉的濁水溪出海口最近有數十隻黑面琵鷺停駐，還發現7隻少見的的東方白鸛，口湖鄉成龍溼地、水林鄉塭底溼地也有大量野鳥，吸引不少賞鳥人士造訪。
